소아 편두통의 두통을 예방하기 위해 사용하는 약물(있는 경우)은 확립되어 있지 않다.

편두통을 앓고 있는 8-17세의 어린이와 청소년들을 대상으로 amitriptyline (1 mg/kg/day), topiramate (2 mg/kg/day), 위약에 대한 무작위, 이중맹검, 위약대조 연구를 실시하였다. 환자들을 2:2:1 비율로 두 약물과 위약군으로 무작위 배정하였다. 일차 평가지표는 24주간의 연구에서 마지막 28일에 편두통이 발생한 날의 수가 기저시점의 28일과 비교해 50% 이상의 상대적 감소로 하였다. 이차 평가지표는 두통관련 장애, 두통 일수, 연구 완료자의 수, 치료기간 동안 생긴 중대한 이상반응이었다.

총 361명이 무작위 배정되었고, 328명이 1차 효능 분석에 포함되었다(amitriptyline군 132명, topiramate군 130명, 위약군 66명). 연구는 계획된 중간 분석 후에 조기 결론을 내렸다. 1차 평가지표의 결과에서 각 군간의 유의한 차이는 없었다. Amitriptyline군에서 52%, topiramate군 55%, 위약군 61%에서 1차 평가지표의 결과를 얻었다. 또한, 두통관련 장애, 두통 일수, 24주간의 치료 완료 환자 비율에서도 각 군간의 유의한 차이가 없었다.

Amitriptyline이나 topiramate를 복용한 환자들의 경우 위약 복용군에 비해 중증 이상반응률이 다음과 같이 높았다. Amitriptyline군에서 피로(30% vs. 14%), 구강건조(25% vs. 12%), topiramate군에서 감각이상(31% vs. 8%) 및 체중감소(8% vs. 0%) 등이 있었다. Amitriptyline군에서 3명은 기분 변화와 관련된 중증 이상반응을 보였으며, topiramate군의 1명은 자살 시도를 하였다.

편두통을 앓고 있는 어린이와 청소년에게 24주간에 걸친 amitriptyline, topiramate, 위약의 복용은 두통의 빈도나 두통 관련 장애를 감소시키는 데 유의한 차이가 없었다. 활성 약물은 높은 이상반응률을 보였다.